黑暗植物完整进化分为自然滋生扩张、多分支巨型成型、黑石侵染异变、净化消亡四个阶段，进化核心条件依托黑石污染环境、持续无光环境、固定地图水土基底三类基础要素，同时植株自身存在生长再生循环，环境光照、雨水、黑水会直接加速或延缓完整进化流程，不同地图的污染浓度会决定黑暗植物最终进化出的形态规模，低污染区域仅生成小型单株黑花，高污染区域会逐步演化出多层分支巨型植株，红石坠落点位的黑暗植物还会额外触发特殊异变形态，满足全部环境条件后植株会进入完全成熟的进化终态，只有持续稳定的烛光燃烧才能打断整条进化链条完成净化。
黑石污染基底是黑暗植物启动进化的底层硬性条件，云野、雨林、暮土、星光沙漠存在原生黑石矿脉与污染水土，土壤、积水长期浸润黑石碎屑后会持续释放暗物质，只要地面存在未清理的黑石残留，黑暗植物就会自动完成基础滋生进化，雨林雨水会溶解黑石扩大污染范围，暮土黑水会大幅提升暗物质浓度，让小型植株快速长出侧枝进入下一阶进化，云野浅淡污染仅能维持单瓣小型黑暗植物，不会演化多层分支，而红石坠落区域的黑石会和红石能量叠加，催生带有红色微光的异变黑暗植物，这类植株进化速度是普通黑花的三倍，再生复原能力更强，单纯短暂烛光无法阻断其持续进化。
无光低光照环境是黑暗植物进阶扩张进化的必要条件，地图内山洞、桥底、沉船船舱、四龙图洼地等长期遮蔽自然光的区域，缺少天空光源压制暗物质，滋生出的基础黑暗植物会快速分裂分支完成二次进化，露天开阔地带受持续天光限制，植株仅能维持最小形态，即便存在黑石基底也不会生长多层结构，雨林持续降雨会遮蔽天光，整片密林遗迹天然满足无光进化条件，成为巨型黑暗植物高发点位；若区域内存在常驻光源，比如固定长明烛台、水母群、蝴蝶群，光源释放的微光会中和部分暗物质，延缓植株分支进化，长期点亮区域烛火可直接抑制黑暗植物完成完整进化，大幅降低后续清理难度。
植株再生循环机制是黑暗植物反复进化的关键补充规则，未被烛光完全燃烧殆尽的黑暗植物会保留暗物质根茎，根茎在满足黑石、无光两大条件后，短时间内重新萌发，重复完成滋生、分支的进化流程，巨型多分支黑暗植物的根茎分布在所有分支底部，仅烧毁单侧分支无法破坏根茎，剩余根茎会持续吸收污染能量让分支复原，重新回到成熟进化形态，暮土大型植株根茎扎根黑水淤泥，进化复原速度更快，单人清理极易出现反复再生；多人同步燃烧所有分支、持续烛光灼烧根茎核心，才能彻底摧毁根茎阻断二次进化，搭配长椅道具垫高站位稳定持续点火，可一次性打断完整进化循环，避免植株重复滋生。
环境特殊变量会改变黑暗植物进化速度与最终形态，雨林降雨会持续消耗角色烛光，打断燃烧净化流程，给黑暗植物留出充足时间完成完整进化，暮土黑水会持续侵蚀角色斗篷能量，单人长时间守花难度大幅提升，螃蟹冲撞会瞬间熄灭烛光，让已半净化的植株快速复原进化；破晓季红石点位的异变黑暗植物进化完成后会产出红石碎片，普通黑石环境进化成熟植株仅产出普通烛火，日常跑图清理黑暗植物时优先清理山洞、沉船这类无光高污染点位，提前点亮周边常驻光源，组队分工同步灼烧分支根茎，能从根源减少黑暗植物完成成熟进化的概率，提升每日净化任务与烛火收集效率。
